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目前市面上常用的碳源：甲醇、乙酸、乙酸钠、面粉、葡萄糖、生物质碳源及污泥水解上清液等。在使用过程中，需要根据实际工程情况选择合适的碳源。
甲醇作为外碳源具有运行费用低和污泥产量小的优势，在甲醇碳源不足时，存在亚硝酸盐积累的现象。以甲醇为碳源时的反硝化速率比以葡萄糖为碳源时快3倍，其 碳氮比（COD：氨氮）为 2.8～3.2 。
但甲醇作为外加碳源时，有以下3点问题需关注：
甲醇易燃，为甲类危化品，储存和使用均有严格要求。特别是其储存需报当地公安部门备案审批，手续繁琐。
微生物常用的复合碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。有机碳源包括各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等。微生物生长繁殖或积累代谢产物的营养基质。任何培养基中均需含有微生物所必需的能源、碳源、氮源、矿质元素、水和生长因素，但不同营养类型、不同种类的微生物对营养元素的要求又有很大差异。
随着社会的发展，净水药剂的种类也是越来越多，根据污水的成分的不同，我们需要选择不同的药剂来投加。污水厂水处理培菌碳源有工业面粉，尿素，磷肥，工业葡萄糖，乙酸钠等，今天我们要讲的就是新型复合碳源，这种复合碳源由多种有机物氨基酸组成，投加量少，可以起到快速培菌的作用，且使用后水质比较稳定。复合碳源用于促进反硝化脱氮异养菌群快速繁殖，提高微生物净化能力，生化系统处理能力和抗冲击力的一种新型复合性营养素。本品具有、快速、低耗、且生物友好的特点。
复合碳源作为一种新型生物碳源，可以促进水处理的脱氮效果、增强不同菌群的繁殖能力，大大提高污水的脱氮效果。复合碳源生物利用率高，能使不同菌群快速繁殖，加快污水处理效率。与普通碳源相比，同样的复合碳源处理量可节省40％50％可以说是为反硝化细菌定制的新型碳源，整体性价比高于醋酸、乙酸钠等产品！经多年使用，碳源成本降低，无副作用，生物亲和性好它用于城市化污水处理、食品加工、工业电镀行业发挥着不可替代的作用！