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生物质碳源随着污水脱氮要求的提高，新兴起专业生产碳源的企业，他们通过生物工程原理，对一些糖类、农产品废料等进行发酵，生产无害的生物制品，主要组分是小分子有机酸、醇类、糖类。其较单一的化学品更容易被微生物利用，其使用成本比单一化学品便宜，具备极高的性价比。
但其弊端：
产品的稳定性待提高，使用前需对每批次产品当量COD进行检测。
污泥水解上清液
生物转化挥发酸VFA 来源于污泥水解的上清液，由于水解所产生的 VFA 拥有很高的反硝化速率，碳源可以直接由污水厂内部提供，在污泥减容的同时还减少了碳源运输方面的问题，所以它是目前比较有优势的碳源。
生物复合碳源对于污泥水解利用做外碳源的研究，目前不同的结论有很多，但总体认为它作为反硝化脱氮系统的碳源是一种很有价值的方法。
复合碳源
复合碳源, 含微生物促升剂, 含微生物微量元素, 更适合微生物生长和繁育, 更加的处理水中污染物, 在细胞体内进行反硝化时作为电子供体, NOx-N 为电子受体, 其生化途径具有多条途径, 不会受到某些途径中关键酶的影响, 减少了碳源用于其它代谢途径的损耗。
复合碳源强化生物脱氨除磷机理:
在厌氧环境下, 通过发酵得到乙酸盐和丙酸盐, 同时将 VFAs 转化成 PAH, 并伴随着正磷盐的释放。其次, 厌氧条件下, 无论是否有正磷盐的释放, 有机高分子都将终被转化成PAH。
微生物常用的复合碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。有机碳源包括各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等。微生物生长繁殖或积累代谢产物的营养基质。任何培养基中均需含有微生物所必需的能源、碳源、氮源、矿质元素、水和生长因素，但不同营养类型、不同种类的微生物对营养元素的要求又有很大差异。
随着社会的发展，净水药剂的种类也是越来越多，根据污水的成分的不同，我们需要选择不同的药剂来投加。污水厂水处理培菌碳源有工业面粉，尿素，磷肥，工业葡萄糖，乙酸钠等，今天我们要讲的就是新型复合碳源，这种复合碳源由多种有机物氨基酸组成，投加量少，可以起到快速培菌的作用，且使用后水质比较稳定。复合碳源用于促进反硝化脱氮异养菌群快速繁殖，提高微生物净化能力，生化系统处理能力和抗冲击力的一种新型复合性营养素。本品具有、快速、低耗、且生物友好的特点。
糖类碳源，以面粉、蔗糖、葡萄糖为主，由于葡萄糖是简单的糖，所以目前研究比较多。当碳源充足时，以葡萄糖为碳源的 碳氮比较甲醇为碳源时高得多，为 6∶1～7∶1。碳源对硝氮的比还原速率几乎没有影响，但是对亚硝氮的比积累速率影响较大，在研究中发现只有葡萄糖作为外加碳源时对亚硝氮的比累积速率没有影响。
以葡萄糖为代表的糖类物质作为外加碳源使得脱氮效果良好，可是，糖类作为多分子化合物，容易引起细菌的大量繁殖，导致污泥膨胀，增加出水中COD的值，影响出水水质，同时，与醇类碳源相比，糖类物质更容易产生亚硝态氮积累的现象。
但其弊端有二点：
需要现场配置成溶液，劳动强度大，投加精准性差，大型污水处理厂无法使用。
工业葡萄糖含杂质多，食品葡萄糖价格贵。